Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SERINC1Q9NRX5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERINC1Q9NRX5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms