Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms