Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLSPNQ9HAW4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSPNQ9HAW4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms