Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SCAF1Q9H7N4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCAF1Q9H7N4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms