Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTDSP1Q9GZU7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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CTDSP1Q9GZU7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CTDSP1Q9GZU7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1Q9GZU7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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