Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNHG12Q9BXW3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms