Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3CQ9BUI4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3CQ9BUI4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms