Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM42Q9BTD8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM42Q9BTD8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms