Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TIMM29Q9BSF4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TIMM29Q9BSF4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms