Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPSNAP3BQ9BS92 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms