Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2Q9BQY4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms