Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CMSS1Q9BQ75 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CMSS1Q9BQ75 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms