Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms