Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms