Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
JSRP1Q96MG2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms