Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NSMCE2Q96MF7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms