Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms