Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUB1Q96FW1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms