Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA3Q96EY1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms