Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms