Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EME1Q96AY2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms