Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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