Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX21Q969T3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms