Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms