Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC4Q8WW27 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms