Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms