Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGBL3Q8NEM8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGBL3Q8NEM8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGBL3Q8NEM8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGBL3Q8NEM8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms