Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPC24Q8NBT2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms