Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMER3Q8N944 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms