Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CLDN19Q8N6F1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CLDN19Q8N6F1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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CLDN19Q8N6F1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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CLDN19Q8N6F1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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CLDN19Q8N6F1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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CLDN19Q8N6F1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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CLDN19Q8N6F1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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