Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIBP1Q86W92 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms