Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMC4Q7Z404 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms