Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NLRP9Q7RTR0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms