Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N1

COPS6, COP9 signalosome complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS6Q7L5N1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COPS6Q7L5N1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS6Q7L5N1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms