Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
XIRP1Q702N8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XIRP1Q702N8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms