Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
BBS12Q6ZW61 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms