Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPN12Q6ZSI9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPN12Q6ZSI9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms