Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LRIG3Q6UXM1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms