Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL17Q6UXB2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL17Q6UXB2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms