Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L9Q6RFH8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L9Q6RFH8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L9Q6RFH8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L9Q6RFH8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L9Q6RFH8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L9Q6RFH8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L9Q6RFH8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L9Q6RFH8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L9Q6RFH8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L9Q6RFH8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L9Q6RFH8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L9Q6RFH8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L9Q6RFH8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L9Q6RFH8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L9Q6RFH8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L9Q6RFH8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L9Q6RFH8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L9Q6RFH8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4L9Q6RFH8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms