Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM88Q6PEY1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms