Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED27Q6P2C8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms