Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms