Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USPL1Q5W0Q7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USPL1Q5W0Q7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms