Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms