Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODF2Q5BJF6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF2Q5BJF6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms