Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZBED5Q49AG3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms