Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms