Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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RTL8BQ17RB0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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RTL8BQ17RB0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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RTL8BQ17RB0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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RTL8BQ17RB0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTL8BQ17RB0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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