Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCK2Q16822 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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